Нужно зависимость от update-pepperflash заменить на ppapi-plugin-adobe-flash. Тогда с firefox можно в дистрибутив нормально включить.
Я в ppapi-plugin-adobe-flash заобсолетил, но лучше исправить, т.к. update-pepperflash можно уже выбросить.
freshplayerplugin-0.3.5-alt2 -> sisyphus: * Thu Sep 29 2016 Gleb F-Malinovskiy <glebfm@altlinux> 0.3.5-alt2 - Replaced R: update-pepperflash with ppapi-plugin-adobe-flash (ALT#32516).